Die Primarschule Mettmenstetten ist eine geleitete Schule. Mit der Schulleitung hat sie eine professionelle Führung vor Ort.
Die Schulpflege ist verantwortlich für die strategische Ausrichtung und Planung der Primarschule. Sie überwacht die Umsetzung und unterstützt die Schulleitung und die Lehrpersonen in ihrer Arbeit.
Die Schulverwaltung ist Informationsstelle für die Primarschule und übernimmt für die Schulpflege und die Schulleitung administrative und organisatorische Aufgaben.